Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP9Q8IXQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP9Q8IXQ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP9Q8IXQ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP9Q8IXQ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP9Q8IXQ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP9Q8IXQ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP9Q8IXQ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms