Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms