Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF3Q86WH2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms