Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms