Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT27Q7Z3Y8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms