Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms