Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM15Q7Z3B0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms