Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTOP2Q7RTS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms