Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms