Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT2Q6UVM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT2Q6UVM3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms