Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BLOC1S2Q6QNY1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms