Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms