Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms