Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms