Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSAPQ6IQ19 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms