Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
OTUD7BQ6GQQ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms