Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms