Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF4Q5VUM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms