Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms