Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39BQ5VTQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39BQ5VTQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39BQ5VTQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39BQ5VTQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms