Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms