Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms