Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHC1Q5JVL4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHC1Q5JVL4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms