Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNT1Q5JUK3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms