Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms