Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms