Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms