Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN3Q4LDR2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms