Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms