Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYSND1Q2T9J0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms