Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms