Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms