Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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