Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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