Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN1Q16512 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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