Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms