Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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