Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1AQ15573 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1AQ15573 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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