Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
R3HDM1Q15032 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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