Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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