Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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COL4A6Q14031 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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COL4A6Q14031 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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COL4A6Q14031 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A6Q14031 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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