Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CKAP5Q14008 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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