Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBFBQ13951 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms