Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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