Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms