Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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