Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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