Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLFQ13129 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLFQ13129 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLFQ13129 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLFQ13129 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLFQ13129 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLFQ13129 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLFQ13129 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLFQ13129 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLFQ13129 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLFQ13129 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLFQ13129 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLFQ13129 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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