Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
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