Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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